Президент США Барак Обама встретился с Алленом и принял его отставку. Бывший командующий силами НАТО в Афганистане не стал претендовать на пост главкома всеми силами Североатлантического альянса.
Аллен попал под подозрение в связи со скандалом, связанным с бывшим главой ЦРУ Петреусом. И хотя потом подозрения с Аллена были сняты, более того Обама высказался за его кандидатуру на пост главнокомандующего всеми силами НАТО, Аллен предпочел отставку дальнейшей службе.
Он изъявил желание отойти на покой и заняться здоровьем, слегка пошатнувшимся за годы службы и семьей.